Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Frem2Q6NVD0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem2Q6NVD0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms