Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retreg2Q6NS82 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retreg2Q6NS82 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms