Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcd11Q6NS46 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms