Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms