Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smarca2Q6DIC0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca2Q6DIC0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms