Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Thsd7aQ69ZU6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd7aQ69ZU6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms