Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk13Q69ZA1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms