Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Znf280dQ68FE8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Znf280dQ68FE8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Znf280dQ68FE8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Znf280dQ68FE8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Znf280dQ68FE8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Znf280dQ68FE8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Znf280dQ68FE8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Znf280dQ68FE8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Znf280dQ68FE8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Znf280dQ68FE8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Znf280dQ68FE8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Znf280dQ68FE8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Znf280dQ68FE8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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