Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms