Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp4eQ66X19 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms