Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pan3Q640Q5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms