Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ift52Q62559 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift52Q62559 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms