Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxa13Q62424 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa13Q62424 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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