Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

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Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtmQ62388 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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AtmQ62388 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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AtmQ62388 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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AtmQ62388 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtmQ62388 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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AtmQ62388 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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AtmQ62388 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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AtmQ62388 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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AtmQ62388 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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AtmQ62388 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtmQ62388 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtmQ62388 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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