Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Supt6hQ62383 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms