Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd47Q61735 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd47Q61735 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd47Q61735 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd47Q61735 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd47Q61735 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd47Q61735 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd47Q61735 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd47Q61735 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd47Q61735 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd47Q61735 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd47Q61735 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd47Q61735 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd47Q61735 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms