Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd2Q61285 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms