Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rbbp7Q60973 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp7Q60973 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms