Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod1Q60867 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms