Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms