Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms