Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brip1Q5SXJ3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms