Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms