Protein–RNA interactions for Protein: Q5QNQ9

Col27a1, Collagen alpha-1(XXVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,845 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col27a1Q5QNQ9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Col27a1Q5QNQ9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col27a1Q5QNQ9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col27a1Q5QNQ9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms