Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms