Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH2

Tsr3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr3Q5HZH2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr3Q5HZH2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms