Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnni3kQ5GIG6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms