Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms