Protein–RNA interactions for Protein: Q571E5

Prss53, Serine protease 53, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss53Q571E5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Prss53Q571E5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss53Q571E5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss53Q571E5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss53Q571E5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss53Q571E5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss53Q571E5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss53Q571E5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss53Q571E5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss53Q571E5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss53Q571E5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss53Q571E5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms