Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx33Q4VAA7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx33Q4VAA7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx33Q4VAA7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx33Q4VAA7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx33Q4VAA7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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