Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms