Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx25Q3ZT31 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx25Q3ZT31 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx25Q3ZT31 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx25Q3ZT31 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx25Q3ZT31 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx25Q3ZT31 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx25Q3ZT31 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx25Q3ZT31 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx25Q3ZT31 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx25Q3ZT31 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms