Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms