Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Dnah12Q3V0Q1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Dnah12Q3V0Q1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Dnah12Q3V0Q1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnah12Q3V0Q1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms