Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prr7Q3V0I2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms