Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc27Q3V036 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc27Q3V036 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc27Q3V036 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc27Q3V036 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc27Q3V036 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc27Q3V036 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc27Q3V036 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms