Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms