Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms