Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm5aQ3UXZ9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms