Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb2Q3UUV9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms