Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms