Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3UPC7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3UPC7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3UPC7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3UPC7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3UPC7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3UPC7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms