Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms