Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp30Q3UN04 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp30Q3UN04 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp30Q3UN04 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp30Q3UN04 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp30Q3UN04 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp30Q3UN04 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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