Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms