Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ell2Q3UKU1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms