Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ceacam5Q3UKK2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms