Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smu1Q3UKJ7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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