Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Usp19Q3UJD6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Usp19Q3UJD6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Usp19Q3UJD6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Usp19Q3UJD6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Usp19Q3UJD6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Usp19Q3UJD6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Usp19Q3UJD6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Usp19Q3UJD6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Usp19Q3UJD6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Usp19Q3UJD6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms