Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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